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siRNA轉(zhuǎn)染標準操作流程

更新時間:2025-07-16點擊次數(shù):485

以下是經(jīng)過優(yōu)化的 siRNA轉(zhuǎn)染標準操作流程,整合了關(guān)鍵參數(shù)優(yōu)化與避坑指南,適用于絕大多數(shù)哺乳動物細胞系(貼壁/懸?。?,分為 實驗設(shè)計、操作步驟、質(zhì)控要點三部分:

一、實驗設(shè)計關(guān)鍵點(轉(zhuǎn)染前必看)

要素

推薦方案

避坑提示

siRNA濃度

終濃度10-50nM(預實驗梯度測試)

100nM易致脫靶效應

細胞密度

貼壁細胞:30-50%匯合度
懸浮細胞:2-5×10?/mL

過密毒性;過低效率

轉(zhuǎn)染試劑

Lipofectamine™ RNAiMAX(通用)
jetPRIME®(原代/難轉(zhuǎn)細胞)

避免含血清培養(yǎng)基稀釋試劑

對照設(shè)置

- 陰性對照:Scrambled siRNA
- 陽性對照:GAPDH siRNA
- 空白對照:僅轉(zhuǎn)染試劑

缺一不可!












二、標準操作流程(以24孔板為例)

 Day 0:細胞鋪板

1. 消化細胞 用wanquan培養(yǎng)基 調(diào)整密度 每孔接種 0.5mL(貼壁細胞數(shù):5-8×10?;懸浮細胞數(shù):2×10?)  

2. 37℃培養(yǎng)箱放置 16-24h(目標:轉(zhuǎn)染時匯合度≈40%)  

關(guān)鍵細節(jié):  

- siRNA工作液濃度 = 儲存濃度×30(例:20μM儲存液工作液終濃度≈33nM)  

- 轉(zhuǎn)染試劑用量參考說明書(RNAiMAX通常 試劑:siRNA體積比=1:1)  

 Day 2:換液與檢測  

1. 轉(zhuǎn)染后 6h 更換wanquan培養(yǎng)基(高毒性細胞如原代神經(jīng)元需4h內(nèi)換液)  

2. 繼續(xù)培養(yǎng) 24-72h(基因沉默峰值時間需預實驗確定)  

 三、質(zhì)控關(guān)鍵步驟(決定成?。。?/span>

 1. 轉(zhuǎn)染效率驗證(必做)

- 方案1:轉(zhuǎn)染 FAM標記siRNA → 24h后熒光顯微鏡觀察(效率>80%合格)  

- 方案2:共轉(zhuǎn)染 EGFP質(zhì)粒 計算綠色細胞占比(成本低但間接)  

 2. 沉默效果檢測

 3. 細胞毒性評估

- MTT法:轉(zhuǎn)染后24h檢測,存活率應>85%  

- 形態(tài)觀察:懸浮細胞聚團、貼壁細胞空泡化提示毒性過強  

 四、高頻問題解決方案

問題

原因

優(yōu)化方案

效率低

siRNA降解/試劑失效

新解凍siRNA;更換轉(zhuǎn)染試劑批次

細胞死亡率高

復合物局部濃度過高

轉(zhuǎn)染前混勻培養(yǎng)基;懸浮細胞用旋轉(zhuǎn)培養(yǎng)法

沉默效果不穩(wěn)定

基因半衰期長

延長檢測至72h;轉(zhuǎn)染兩次(間隔24h

脫靶效應

siRNA種子區(qū)匹配非靶基因

更換siRNA序列;使用化學修飾siRNA(如Stealth™

五、特殊細胞優(yōu)化方案

1. 原代細胞:  

   - 轉(zhuǎn)染試劑:選 DharmaFECT™ Primary jetPRIME®  

   - 方案:轉(zhuǎn)染前饑餓處理2h(無血清培養(yǎng)基)復合物孵育時間縮短至5min  

2. 懸浮細胞:  

   - 試劑:Neofect™ DNA/RNA Transfection Reagent  

   - 步驟:離心收集細胞 重懸于復合物 → 24孔板每孔接種500μL(密度5×10?/mL)  

3. 難轉(zhuǎn)細胞(如神經(jīng)元):  

   - 專用試劑:NeuroFect™(佐劑提高穿透性)  

   - 轉(zhuǎn)染后不換液 直接補等體積wanquan培養(yǎng)基  

六、試劑耗材推薦表

類型

推薦產(chǎn)品

適用場景

通用轉(zhuǎn)染試劑

Lipofectamine™ RNAiMAX

293T/HeLa等常見細胞

難轉(zhuǎn)細胞試劑

jetPRIME®

原代/干細胞/懸浮細胞

陽性對照siRNA

Silencer™ GAPDH siRNA

體系驗證

陰性對照

AllStars Neg. siRNA

排除非特異效應

> 數(shù)據(jù)標準:合格實驗需滿足——轉(zhuǎn)染效率>80% + 沉默效率>70% + 細胞存活>85%

避雷總結(jié):  

1. 勿用含抗生素或血清的培養(yǎng)基稀釋復合物(滅活試劑)  

2. 轉(zhuǎn)染后換液時間寧早勿晚(超8h毒性飆升)  

3. 凍存siRNA避免反復凍融>3次(分裝儲存-80℃)  

按照此流程操作,可穩(wěn)定獲得可重復的基因沉默數(shù)據(jù)!

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